ภาพยนตร์สุดระทึกที่ทำท่าว่าจะอวสานตั้งแต่ภาคที่ 3 เมื่อฮีโร่หญิงอย่างริปลีย์ตัดสินใจฆ่าตัวตาย พร้อมกับเอเลี่ยนในท้อง เพื่อยุติหายนะที่กองทัพจะนำสัตว์มฤตยูพันธุ์นี้ไปดัดแปลงเป็นอาวุธสงคราม และตัวนางเอก ซิเกอร์นี่ย์ วีเวอร์ ยังออกมาประกาศชัดเจนว่าจะไม่ขอต่อกรกับเจ้าตัวเอเลี่ยนในภาคต่อไปอีกแล้ว แต่สุดท้ายด้วยค่าตัว 11 ล้านเหรียญ เธอก็กลับมารับบทริปลีย์อีกครั้ง แถมยังพ่วงตำแหน่งผู้อำนวยการสร้างร่วมอีกด้วย โดยได้สาวหน้าหวาน วิโนนา ไรเดอร์ มาร่วมปราบเอเลี่ยนครั้งนี้
นักวิทยาศาสตร์ของกองทัพ ผ่าศพของริปลีย์นำเอาเอเลี่ยนที่ฝั่งอยู่ในตัวเธอออกมาเพาะพันธุ์เพื่อใช้มันเป็นอาวุธล่าอาณานิคมต่างดาว โดยหารู้ไม่ว่าเอเลี่ยนไม่สามารถฝึกให้เชื่องได้ และทำการ โคลนนิ่ง ริปลีย์ขึ้นมาใหม่ ให้มีส่วนผสมของมนุษย์และดีเอ็นเอของมฤตยูเอเลี่ยน
จนวันหนึ่งสิ่งที่ทุกคนกลัวก็กลายเป็นจริง เมื่อบรรดาเอเลี่ยนแหกกรงออกมา ล่าชีวิตทุกคนบนยาน พวกมันตายยากและแพร่พันธุ์ได้อย่างรวดเร็ว โลกคือแหล่งอาหารสำคัญที่พวกมันต้องการ ริปลีย์คือคนเดียวที่จะกำจัดพวกมันได้ สิ่งแรกที่เธอต้องทำคือกำจัดนางพญาเอเลี่ยน ก่อนที่ทุกอย่างจะสายไป