เรื่องย่อ
เป็นเวลา 14 ปีแล้วที่เกิดการปะทะระหว่างสิ่งมีชีวิตนอกโลกและมนุษยชาติ ตอนนี้ ถึงเวลาที่พวกมันจะกลับมาเปิดศึกเพื่อยึดครองทุกสิ่งบนโลกของเราอีกครั้ง เด็กชายที่ชื่อว่า ชินจิ อิคาริ จึงถูกมาตัวมายังหน่วยลับของ Nerv องค์กรยักษ์ใหญ่ภายใต้การดูแลของสหประชาชาติ เพื่อเป็นผู้บังคับหุ่นยนต์ต่อสู้กับศัตรูร่วมกับเด็กรุ่นราวคราวเดียวกันที่ต้องการปกป้องประเทศชาติ แต่คราวนี้ดูเหมือนว่าศึกหนักที่สุดที่พวกเขาต้องเจอ จะไม่ใช่การปะทะกับอริสุดหิน แต่เป็นการเผชิญหน้ากับพันธมิตรที่เคยรู้ใจกันในอดีตต่างหาก
