วินซ์ กิลลิแกน เกิดในริชมอนด์, เวอร์จิเนีย เติบโตขึ้นมาในเมืองเล็ก ๆ ชื่อฟาร์มวิลล์ในเวอร์จิเนีย เขาเข้าศึกษาที่เอ็นวายยู และสำเร็จการศึกษาสาขางานสร้างภาพยนตร์ ในปี 1989 เขาได้รับรางวัลการเขียนบทจากเทศกาลภาพยนตร์เวอร์จิเนียที่เพิ่งจัดขึ้นได้ไม่นานเท่าไหร่ ซึ่งทำให้เขาเป็นที่สนใจของผู้อำนวยการสร้างมาร์ค จอห์นสัน (Rain Man, The Chronicles of Narnia) กิลลิแกนได้เขียนบทภาพยนตร์เรื่อง Wilder Napalm ที่นำแสดงโดยเด็บบรา วิงเกอร์และเดนนิส เควดรวมไปถึง Home Fries ที่นำแสดงโดย ดรูว์ แบร์รีมอร์ และลุค วิลสัน ให้กับจอห์นสัน
ในปี 1995 กิลลิแกนได้ทดลองชิมลางงานโทรทัศน์ด้วยการรับหน้าที่เป็นมือเขียนบทให้กับซีรีส์ The X-Files เขาทำงานในซีรีส์นี้ได้เจ็ดซีซัน และท้ายที่สุด เขาก็ได้กลายเป็นหนึ่งในผู้อำนวยการสร้างบริหารของซีรีส์และร่วมรับรางวัลลูกโลกทองคำสองครั้ง เขายังได้ช่วยสร้างซีรีส์สปินออฟเรื่อง The Lone Gunmen ด้วย เขาได้เขียนเอพิโซดสำหรับซีรีส์อายุสั้นทางซีบีเอสเรื่อง Robbery Homicide Division ให้กับแฟรงค์ สปอตนิตซ์ หนึ่งในผู้อำนวยการสร้าง X-Files ซึ่งมันทำให้เขาเป็นที่สนใจของไมเคิล แมนน์ ผู้อำนวยการสร้าง Hancock
นอกจากนี้ กิลลิแกนยังเขียนบทภาพยนตร์เรื่อง 2FACE ซึ่งเป็นคอเมดีเกี่ยวกับเชื้อชาติ ให้กับโซนี พิคเจอร์ส และผู้อำนวยการสร้างมาร์ค จอห์นสันอีกด้วย