มาร์คัส แมนนิเนน เติบโตขึ้นมาในสต็อคโฮล์ม ประเทศสวีเดน ภายหลังเขาได้เข้าศึกษาที่คังลิกา เทคนิสกา ฮ็อกสโคแลน (รอยัล อินสติติวท์ ออฟ เทคโนโลยี), สต็อคโฮล์ม และมหาวิทยาลัยแมสซาซูเซทส์ในแอมเฮิร์สท์ ระหว่างศึกษาอยู่ในแมสซาซูเซทส์ แมนนิเนนได้รู้จักแอนนิเมชั่นซีจีและหลงรักมันอย่างจัง และเมื่อเขากลับไปสวีเดนบ้านเกิด เขาก็เลือกทำงานในสายนี้ งานแรกของเขาคือการเป็นผู้จัดการโปรเจ็กต์ให้กับมีเดีย แล็บบอราทอรีที่สถาบันรอยัล อินสติติวท์ ออฟ เทคโนโลยีในสต็อคโฮล์ม
จากนั้น เขาก็เริ่มทำงานเป็นแอนนิเมเตอร์ฟรีแลนซ์ในบ้านเกิดของเขา และไม่นานนัก เขาก็ก่อตั้งไลท์ไซท์ เอบี สตูดิโอแอนนิเมชั่นของตัวเองขึ้นมา เขาได้เข้ารับตำแหน่งซูเปอร์ไวเซอร์ฝ่ายซีจีที่สตูดิโอฟิล์มเทคนาร์นา หลังจากย้ายไปลอนดอน เขาก็ได้รับตำแหน่งหัวหน้าฝ่ายโฆษณาสามมิติที่เฟรมสโตร์ ซีเอฟซี
ผลงานภาพยนตร์เรื่องแรกของเขาคือทริลเลอร์แวมไพร์/มนุษย์หมาป่าเรื่อง Underworld ที่เขาทำหน้าที่นักวาดภาพดิจิตอล เอฟเฟ็กต์ และเขาก็ได้รับหน้าที่ซูเปอร์ไวเซอร์ฝ่ายซีจีในภาพยนตร์แอนนิเมชั่นเรื่อง Over the Hedge และให้คำปรึกษาในช่วงเตรียมงานสร้างภาพยนตร์เรื่อง Bee Movie ภาพยนตร์เรื่อง Kung Fu Panda เป็นผลงานเรื่องแรกของแมนนิเนนกับดรีมเวิร์คส์