หลังจากปิดกล้อง Night at the Museum คาร์ล่า กูจิโน่ก็ร่วมแสดงใน Even Money ผลงานดราม่าอาชญากรรมนำแสดงโดยแดนนี่ เดอวิโต้กับ คิม เบซิงเจอร์ และ Rise ผลงานลุ้นระทึกที่ลูซี่ หลิวนำแสดงจากบทของเซบาสเตียน กัทเทียร์เรซที่เขากำกับเองด้วย
เธอยังเพิ่งร่วมแสดงใน The Lookout ผลงานการกำกับภาพยนตร์เรื่องแรกของ สก๊อต แฟรงค์ ที่นำแสดงโดย โจเซฟ กอร์ดอน-ลิววิตจะออกฉายในปี 2007 แล้วก็ร่วมแสดงใน Entourage ทาง HBO ชุดปีใหม่อีกถึง 6 ตอน เธอร่วมแสดงใน Sin City ของโรเบิร์ต ร็อดดริเกซที่ดัดแปลงจากนิยายภาพของแฟรงค์ มิลเลอร์ และนำแสดงโดย บรู้ซ วิลลิสกับมิคกี้ รู้ค
ผลงานภาพยนตร์ของกูจิโน่ ยังมี Spy Kids ของโรเบิร์ต ร็อดดริเกซทั้งสามภาคที่นำแสดงโดยแอนโตนิโอ แบนเดอราส, The Singing Detective ที่นำแสดงโดย โรเบิร์ต ดาวนีย์ จูเนียร์, โรบิน ไรท์ เพนน์ และเจเรมี่ นอร์แธม, The Center Of The World หนังอาร์ตเฮ้าส์ของเวย์น หวัง และ The One ที่นำแสดงโดย เจ็ท ลี และเดลรอย ลินโด
เธอยังร่วมแสดงใน Creature Feature Part 1: She Creature ของเซบาสเตียน กัทเทียร์เรซ ที่นำแสดงโดย รัฟฟัส ซีเวลทาง Cinemax และ The Jimmy Club ของแฟรงค์ เวลลี่ ที่นำแสดงโดย เวลลี่ กับอีธาน ฮอว์ค
กูจิโน่ยังร่วมแสดงกับ นิโคลาส เคจ นักแสดงหนุ่มเจ้าของรางวัลออสการ์ ใน Snake Eyes ที่กำกับโดยไบรอัน เดอพัลม่า เธอยังอำนวยการสร้างและนำแสดงใน Judas Kiss หนังอิสระที่เอ็มม่า ธอมป์สัน นักแสดงหญิงเจ้าของรางวัลออสการ์ มาร่วมแสดง เธอยังนำแสดงใน The War At Home กับ มาร์ติน ชีน, แคธี่ เบทส์ และ เอมมิลิโอ เอสเตเวซ, Michael กับจอห์น ทราโวลต้า และวิลเลี่ยม เฮิร์ท, Miami Rhapsody กับซาร่าห์ เจสซิก้า ปาร์คเกอร์, This Boy's Life กับโรเบิร์ต เดอนีโร และลีโอนาร์โด ดิคราปริโอ และ Son In Law นอกจากนั้นเธอก็ยังร่วมแสดงใน Lovelife, A Private Matter ของ HBO, The Motorcycle Gang ของ Showtime และ Troop Beverly Hills ซึ่งเป็นผลงานการแสดงภาพยนตร์เรื่องแรกของเธอด้วย
ผลงานทางโทรทัศน์ของกูจิโน่ก็มี Threshold ทาง CBS และนำแสดงใน Karen Sisco ที่สร้างอ้างอิงจากตัวละครของเอลมอร์ เลียวนาร์ด ในนวนิยายเรื่อง Out Of Sight เธอยังร่วมแสดงกับ ไมเคิล เจ ฟ๊อกซ์ใน Spin City, เป็นศัลยแพทย์ระบบประสาทใน Chicago Hope, ภาพยนตร์ของ Hallmark Hall of Fame เรื่อง A Season for Miracles ที่นำแสดงโดย เคธี่ เบทส์, ลอร่า เดิร์น และลินน์ เร็ดเกรฟ เธอเป็นที่ชื่นชมเมื่อรับบทสาวอเมริกัน ที่พยายามดิ้นรนใช้ชีวิตในสังคมเจ้าขุนมูลนายของอังกฤษ ใน The Buccaneers มินิซีรี่ย์ทาง BBC/PBS
กูจิโน่ขึ้นแสดงละครเวที Broadway เรื่องแรกเมื่อฤดูร้อนปี 2004 ใน After the Fall ของอาร์เธอร์ มิลเลอร์ที่ Roundabout Theater นำกลับมาสร้างใหม่ ซึ่งก็เป็นที่ชื่นชมและได้รับการเสนอชื่อเข้าชิงรางวัล Outer Critics' Circle Award และยังคว้ารางวัล Theater World สาขา Outstanding Broadway Debut มาครองด้วย
เธอยังแสดงนำในภาพยนตร์ผจญภัยสำหรับครอบครัวของผู้กำกับแอนดี้ ฟิคแมน เรื่อง Race to Witch Mountain ซึ่งเธอร่วมแสดงกับดเวย์น จอห์นสัน ผลงานใหม่เรื่องอื่น ๆ ของเธอ ได้แก่ภาพยนตร์อินดี้ เรื่อง Every Day และ Electra Luxx ซึ่งกูจิโน่รับบทนำ