สตีเฟ่น แฟงไมเออร์ จบการศึกษาด้านวิทยาศาสตร์ คอมพิวเตอร์ (Computer Science) จาก California State University of Dominguez Hills เมื่อปี 1983 เขาเริ่มงานโปรแกรมเมอร์ และสร้างภาพจากคอมพิวเตอร์ที่ Aerospace Corporation และเป็นผู้จัดการโครงงานสร้างภาพวิทยาศาสตร์ที่ National Center for Supercomputing Application (NCSA) แห่ง University of Illinois ชื่อดังด้วย
ผลงานในวงการบันเทิงชิ้นแรกของ แฟงไมเออร์ เกิดขึ้นในช่วงกลางทศวรรษที่ 80 เมื่อเขาร่วมงานกับ Digital Production ร่วมก่อตั้งกับ จอห์น วิทนี่ จูเนียร์ และสร้างชื่อจาก The Last Starfighter ที่แปลกใหม่มากสำหรับวงการบันเทิงยุคนั้น ซึ่งเขาใช้ผลงานที่สร้างจากคอมพิวเตอร์ช่วยลดค่าใช้จ่ายในการสร้างผลงานโฆษณาและภาพยนตร์ช่วงเศรษฐกิจตกสะเก็ดได้อย่างมาก
เมื่อ Digital Productions ปิดตัวลงในปี 1987 หลังจากที่ Omnibus ควบรวมกิจการไปตั้งแต่ปี 1986 แฟงไมเออร์ ก็ย้ายไปเป็น Director of Production ที่ Mental Images ที่สร้างเครื่องอ่านภาพจากจินตนาการ โดยเขาเป็นผู้ดูแลงานสร้างภาพทั้งหมด ช่วงนี้เองที่เขาได้พบกับผู้ดูแลงานสร้างภาพเอ็ฟเฟ็คอย่าง จอห์น เนลสัน ที่ได้ร่วมงานกับ Imageworks และสร้าง Gladiator ผลงานเจ้าของรางวัลออสการ์ถึงสองสาขา และจอห์น เบอร์ตัน John Berton ที่ได้ร่วมงานกับ ILM และสร้าง I, Robot นั่นเอง)
แฟงไมเออร์ มาร่วมงานกับ ILM ในปี 1990 เพื่อสร้างภายพนตร์เรื่องแรก Terminator 2: Judgment Day โดยเป็น CG shot supervisor หลังจากนั้นก็ร่วมสร้าง Hook, Casper และ Jurassic Park ส่วน Twister ก็เป็นภาพยนตร์เรื่องแรกที่เขานั่งเก้าอี้ VFX Supervisor เต็มตัวและส่งให้เขาได้รับการเสนอชื่อเข้าชิงรางวัลออสการ์ ทั้งยังคว้ารางวัล BAFTA มาครองสำเร็จ หลังจากนั้นก็ร่วมงานใน Small Soldiers, Saving Private Ryan, The Perfect Storm, Galaxy Quest, The Bourne Identity, Signs, Dreamcatcher และ Master and Commander: The Far Side of the World
Lemony Snicket's A Series of Unfortunate Events เป็นภาพยนตร์เรื่องสุดท้ายที่ แฟงไมเออร์ ร่วมงานกับ ILM เขาเคยได้รับรางวัล BAFTA จาก Saving Private Ryan ที่ได้รับการเสนอชื่อเข้าชิงรางวัลออสการ์, ได้รับรางวัล BAFTA จาก The Perfect Storm และยังได้รับการเสนอชื่อเข้าชิง รางวัล Oscar, รางวัล BAFTA และรางวัล VES Award จาก Master and Commander: The Far Side of the World เขาเป็นผู้กำกับคิวบู๊ใน Galaxy Quest และ Dreamcatcher ด้วย
