โจนาธาน เซล่า ทำงานในแวดวงภาพยนตร์, ชิ้นงานโฆษณา, และมิวสิควิดีโอ ผลงานภาพยนตร์ของเขาก็มี Powder Blue, The Midnight Train, The Omen อาถรรพณ์กำเนิดซาตานล้างโลก ของจอห์น มัวร์ เมื่อปี 2006, Marilyn Hotchkiss' Ballroom Dancing & Charm School, Grimm Love, Dreamland, Randy and the Mob, The Little Black Book, The Girl Next Door, Martian Child และหนังสั้นหลายเรื่อง อาทิ The Newman Shower และ Dysenchanted ที่ได้ฉายในเทศกาล Sundance Film Festival ปี 2004 ด้วย
เซล่ายังถ่ายทำมิวสิควิดีโอของเหล่าศิลปินชื่อดังมากหน้าหลายตา อาทิ Christina Aguilera, Sheryl Crow, Beyonce, Britney Spears, Jennifer Lopez, Rhianna, Black Eyed Peas, Prince, Lindsay Lohan, Justin Timberlake, Destiny's Child, Enrique Iglesias, Metallica, Green Day, AFI, Counting Crows, Alicia Keys, Usher, 50 Cent และ Incubus เป็นต้น
เซล่ายังถ่ายทำชิ้นงานโฆษณาให้กับผลิตภัณฑ์ดัง ๆ อย่าง Reebok, Coca-Cola, Six Flags Magic Mountain, Nintendo, Burger King, Bacardi, Playstation, McDonald's, Hanes, Cingular, Chase Bank, John Frieda, Jergens, Kay Jeweler's, Cover Girl, Old Navy, Target, State Farm, All State, และ HSBC นอกจากนั้นเขายังได้รับการยกย่องเป็น เลือดใหม่ แห่ง Craft Series ของ The Hollywood Reporter เมื่อปี 2004 ด้วย
