โทนี่ กิลรอยเป็นผู้เขียนบทให้กับภาพยนตร์ Bourne ทั้ง 3 ตอน ซึ่งรวมถึงตอน The Bourne Identity และ The Bourne Supremacy ซึ่งอิงจากนิยายของโรเบิร์ต ลัดลั่ม เขายังเขียนบทหรือร่วมเขียนบทให้กับภาพยนตร์ที่ได้รับคำชมและภาพยนตร์ฮิตมากมายหลายเรื่อง อาทิเช่นผลงานภาพยนตร์ 3 เรื่องของผู้กำกับเทย์เลอร์ แฮ็คฟอร์ด เรื่อง Dolores Claiborne, The Devils Advocate และ Proof of Life กิลรอยยังเขียนบทหรือร่วมเขียนบทให้กับภาพยนตร์เรื่อง The Cutting Edge, For Better and for Worse, Extreme Measures และ Bait นอกจากนี้ เขายังได้เครดิตจากการดัดแปลงบทให้กับภาพยนตร์เรื่อง Armageddon ด้วย
กิลรอยประเดิมงานกำกับภาพยนตร์เรื่องแรกด้วยภาพยนตร์ทริลเลอร์เรื่องใหม่เรื่อง Michael Clayton ที่นำแสดงโดยจอร์จ คลูนีย์ ซึ่งเขาเขียนบทเองด้วย