บ๊อบบี้ มอยนิฮาน เป็นสมาชิกทีมนักแสดง Saturday Night Live (SNL) มอยนิฮานนรับบท คุณลุงขี้เมาขวัญใจแฟน ๆ ในส่วนของ Weekend Update และได้แสดงบทตัวละครออริจินอลอื่น ๆ อีก รวมถึงริบเล็ท, นักบินอวกาศ เคอร์บี้ เจ. บัตเตอร์ครีม และแอนโธนี คริสปิโน ผู้รายงานข่าวชั้นสอง ผู้รายงานทุกอย่างนอกจากความจริง บุคคลที่เขาเลียนแบบรวมถึงกาย ฟิเอรี, ผู้ว่าการรัฐนิวเจอร์ซีย์ คริส คริสตี้และนิวท์ กินกริช
มอยนิฮานได้พากย์เสีย แพนด้า ในซีรีส์อนิเมชันทางการ์ตูน เน็ตเวิร์คเรื่อง We Bare Bears และตัวละครอีกหลายตัวในซีรีส์อนิเมชันทางฮูลูเรื่อง The Awesomes นอกเหนือจากนั้นเขายังได้รับบทรับเชิญใน The Simpsons เป็นขาประจำซีรีส์อนิเมชันสำหรับเด็กทางพีบีเอสเรื่อง Nature Cat และได้พากย์เสียงซีรีส์ Jake and the Never Land Pirates ทางดิสนีย์ แชนแนล ผลงานจอแก้วเรื่องอื่นๆ ของเขารวมถึงซีรีส์เอชบีโอเรื่อง Girls, ซีรีส์ไอเอฟซีเรื่อง Portlandia และ Comedy Bang! Bang!
ผลงานภาพยนตร์ของเขารวมถึง Sisters ที่นำแสดงโดยทีนา เฟย์และเอมี โพห์เลอร์, Staten Island Summer, ภาพยนตร์พิกซาร์เรื่อง Inside Out, Monsters University, The Invention of Lying, Grown Ups 2 และ When in Rome หลังจากนี้ เขาจะได้แสดงในภาพยนตร์เรื่อง Brother in Laws ประกบเพื่อนร่วมแสดงจาก SNL ทารัน คิลแลม, ภาพยนตร์โดยโคลิน เทรเวอร์โรว์เรื่อง The Book of Henry และ Why Were Killing Gunther ซึ่งนำแสดงโดยอาร์โนลด์ ชวอร์ซเนกเกอร์